Estudio de asociación de genoma completo (GWAS) para la identificación de genes relacionados a la respuesta hidrotrópica en maíz ancho (Zea mays L.) nativo mexicano en el IBt – UNAM
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Fecha
2023-12
Autores
Olvera-Hernández, Roberto
Título de la revista
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Editor
ITESO
Resumen
Descripción
México es centro de origen, domesticación y diversificación del maíz. Además de ser pilar de la gastronomía mexicana, el maíz Ancho (Zea mays L.) es un alimento fundamental para el auto abasto y economía de grupos campesinos e indígenas en la ruralidad del estado de Morelos. Debido a la falta de agua, estos grupos han optado por productos menos rentables o híbridos foráneos resistentes a sequía. Para satisfacer sus necesidades y proteger la biodiversidad local, se propone generar variedades resistentes a sequía mediante el entrecruzamiento de accesiones locales con respuesta hidrotrópica (RH) robusta en sus raíces. En este PAP, a través de un Estudio de Asociación de Genoma Completo (GWAS), se identificaron marcadores moleculares (SNPs) y genes asociados con la RH en accesiones nativas de Z. mays L. Después de realizar ensayos de selección, 119 accesiones provenientes de los municipios Huitzilac y Puente de Ixtla, Morelos fueron secuenciadas por DArTseq en las que se encontraron 13,249 SNPs de calidad. Un GWAS basado en MLM demostró que existen 56 SNPs asociados a la RH, de los cuales, se lograron identificar dos genes asociados: CAND1 (transporte de auxinas) y ABAC7 (proteína de transporte activo) por medio de búsqueda de ortólogos en A. thaliana. Ambos genes representan parte de un mecanismo molecular más complejo, y pueden servir como marcadores de selección para entrecruzamiento.
Palabras clave
Sustentabilidad y Tecnología, Apoyo a Centros de Investigación Externos